Письмо ФНС России от 30 декабря 2015г. № БС-4-11/23300@
Налоговые агенты - российские организации, имеющие обособленные подразделения, обязаны перечислять исчисленный и удержанный НДФЛ в бюджет как по месту своего нахождения, так и по месту нахождения каждого своего обособленного подразделения.
НДФЛ, исчисленный и удержанный с выплат работникам обособленных подразделений, перечисляется в бюджет по месту учета в налоговом органе соответствующего обособленного подразделения независимо от того, имеет оно отдельный баланс и счет или нет. Этот порядок применяется независимо от того, работают сотрудники в обособленном подразделении по трудовым договорам или договорам гражданско-правового характера.
Налоговые агенты обязаны с 1 января 2016 года представлять форму 2-НДФЛ за 2015 год и ежеквартальную форму 6-НДФЛ в налоговый орган по месту своего учета.
А в отношении работников обособленных подразделений - в налоговый орган по месту учета таких подразделений, а также в отношении физических лиц, получивших доходы по гражданско-правовым договорам - в налоговый орган по месту учета обособленных подразделений, заключивших эти договоры от имени организации.