Решением Совета депутатов Одинцовского района Московской области от 18.11.2005 № 5/3 ЕНВД введен на территории Одинцовского района Московской области в отношении деятельности по оказанию услуг по предоставлению во временное владение (в пользование) мест для стоянки автотранспортных средств, а также по хранению автотранспортных средств на платных стоянках (за исключением штрафных автостоянок).
При этом, обязательный перевод на ЕНВД отменен с 1 января 2013 года. Применение системы налогообложения в виде ЕНВД осуществляется на добровольной основе (п. 1 ст. 346.28 НК РФ). Таким образом, предоставление в аренду части земельного участка под парковку арендаторам на возмездной основе не влечет обязательность применения ЕНВД для Вашей организации.
Сумма НДС по приобретенным товарам (работам, услугам), в том числе основным средствам и нематериальным активам, имущественным правам, при отсутствии у налогоплательщика раздельного учета не подлежит вычету и не включается в расходы, принимаемые к вычету при исчислении налога на прибыль организаций (п. 4 ст. 170 НК РФ).
Кроме того, суммы НДС, принятые к вычету налогоплательщиком по товарам (работам, услугам), в том числе основным средствам и нематериальным активам, и имущественным правам в порядке, предусмотренном главой 21 НК РФ «НДС», подлежат восстановлению в налоговом периоде, предшествующем переходу на указанный режим (подп. 2 п. 3 ст. 170 НК РФ).
Обязанность ведения раздельного учета имущества, обязательств и хозяйственных операций при совмещении ОСНО и спецрежима в виде ЕНВД прописана в пункте 7 статьи 346.26 НК РФ.
В главе 16 «Виды налоговых правонарушений и ответственность за их совершение» НК РФ отсутствуют положения, согласно которым организацию могут привлечь к ответственности за неведение раздельного учета.
Отсутствие раздельного учета, как правило, приводит к неверному исчислению налогооблагаемой базы по НДС и налогу на прибыль и, соответственно, суммы налога, которая подлежит уплате в бюджет. В этом случае, организации вряд ли удастся избежать штрафных санкций по статье 122 НК РФ.
Так, в Постановлении Арбитражного суда Западно-Сибирского округа от 20.08.2015 № Ф04-21371/2015 по делу № А75-5600/2014 рассматривалась следующая ситуация, в которой арбитры поддержали налоговую инспекцию. В ходе налоговой проверки проверяющие установили отсутствие ведения налогоплательщиком раздельного учета, самостоятельно исчислили пропорцию общей выручки по реализации товаров к операциям, подлежащим налогообложению по общей системе; расчет налога произвели исходя из пропорции, определенной в порядке, предусмотренном пунктом 9 статьи 274 НК РФ.
Вывод: Действующий закон не содержит обязанности перейти на ЕНВД по деятельности платных парковок. Если организация примет решение применять ЕНВД по этому виду деятельности в добровольном порядке, то ведение раздельного учета доходов и расходов, полученных от деятельности на ЕНВД, для нее обязательно.