Письмо ФНС России от 28 июля 2014 г. N ЕД-4-2/14546
Разъяснен вопрос начисления и вычета НДС при обмене электронными документами.
Если отгрузка товаров произведена в последний день квартала, а файл со счетом-фактурой отправлен оператору 15-го числа месяца, следующего за истекшим кварталом, то дата отгрузки (передачи) товаров (работ, услуг) является моментом определения налоговой базы по НДС.
Счет-фактура по товарам, отгруженным в последний день квартала, регистрируется в книге продаж в том квартале, в котором произошла их отгрузка.
Покупателю следует зарегистрировать его в журнале учета полученных счетов-фактур в следующем квартале этого года.
Таким образом, если счет-фактура составлен продавцом в одном налоговом периоде, а получен покупателем в следующем налоговом периоде, то при условии принятия на учет товаров (работ, услуг), вычеты сумм налога отражаются в декларации за тот налоговый период, в котором счет-фактура фактически получен.