ФНС усиливает контроль за применением налоговых льгот. Очередным подтверждением стали отмеченные в СМИ претензии налоговых органов более чем к 50 компаниям-резидентам «Сколково». После утраты права на льготы участников инновационного центра они применяли общеотраслевые преференции для аккредитованных IТ-компаний. Налоговые органы считают, что после утраты «сколковских» льгот компания не может в том же налоговом периоде воспользоваться «льготной» ставкой по налогу на прибыль для IТ-компаний и доначисляют налог.
Что происходит
ФНС указывают на необходимость применения 25% (20%) ставки по налогу на прибыль (п.1 ст. 284 НК РФ) за год, в котором участник проекта «Сколково» одновременно превысил порог 1 млрд руб. выручки и 300 млн руб. прибыли, даже когда компания удовлетворяет условиям применения льготной ставки по налогу на прибыль, предусмотренной для IТ-компаний (письмо от 20.10.2025 года № СД-4-3/9400@). Минфин придерживается этой же точки зрения (от 12.08.2025 № 03-03-06/1/78068, от 20.06.2023 № 03-03-06/1/56962).
Например, организация, утратившая в течение 2024 года право на применение налоговой ставки в размере 0 % как участник проекта «Сколково» из-за превышения совокупного размера прибыли — не вправе с первого дня налогового периода 2024 года применять «нулевую», предусмотренную для аккредитованных IT-компаний (п. 1.15 ст. 284 НК РФ).
Также с 01.01.2026 года вне зависимости от выполнения иных условий, льготная ставка по налогу на прибыль и льготный тариф по страховым взносам, установленные для аккредитованных ИТ-компаний, не подлежат применению компаниями со статусом участника проекта «Сколково» (абз. 22 п. 1.15 ст. 284, абз. 23 п. 5 ст. 427 НК РФ, п. 62, п. 140 Закона от 28.11.2025 г. N 425-ФЗ). Т.е. в 2026 году применять налоговые льготы, предусмотренные для IT-компаний, организация может только при отказе от статуса участника «Сколково». Ранее была возможность выбора льгот между «сколковскими» и общеотраслевыми (в т.ч. IT- льготами) и претензий со стороны налоговых органов не было. Теперь нужно выбирать только один вид «преференций».
В 2026 году налоговые льготы становятся объектом повышенного внимания ФНС, а цифровой контроль позволяет выявлять нарушения и доначислять налоги не только в рамках выездных проверок, а значительно быстрее в рамках камерального контроля и риск-аналитики.
Фактически льготы переходят из категории безопасная «налоговая экономия» в категорию «налоговый риск», если не учитывать законодательные изменения, позицию контролирующих органов и не подготовить заранее подтверждения обоснованности применения налоговых преференций.
Кто может попасть в зону налогового риска
Особое внимание стоит уделить резидентам «Сколково»; аккредитованным IТ-компаниям; организациям, менявшим статус или структуру бизнеса; бизнесу с пограничной долей IТ-выручки; компаниям, использующим одновременно несколько «режимов преференций»; группам компаний, где льготы распределяются между взаимозависимыми лицами (тема «дробления» также очень актуальна для ФНС).
Что это значит для бизнеса
События вокруг IT-компаний, резидентов «Сколково» показывают важную тенденцию 2026 года — ФНС все активнее контролирует не только уплату налогов, но и обоснованность получения налоговых преференций и делает это максимально оперативно. В 2026 могут проверить и предъявить претензии с доначислениями не только за прошлые годы (2023-2025), но и за текущий. Поэтому важно быть готовым обосновать право на налоговую преференцию, налоговый вычет по НДС, расходы по налогу на прибыль — в любой момент. Не оставляйте проверку ошибок в учете и налогах до конца года-это уже поздно и дорого.
помогает вовремя выявлять и исправлять ошибки, управлять рисками и прибылью.
Когда вы в последний раз получали независимую оценку рисков в момент, когда их ещё можно устранить без последствий для вас и бизнеса? — выгодно и с максимальной защитой от налоговых и личных рисков. Узнать подробности и назначить встречу >>
Рекомендуем наши статьи:
- ;
- .
